Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptcd3Q14C51 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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