Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q149G0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q149G0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms