Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Traf3ip1Q149C2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Traf3ip1Q149C2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Traf3ip1Q149C2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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