Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Perm1Q149B8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms