Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms