Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms