Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnnm1Q0GA42 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms