Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MestQ07646 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms