Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms