Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms