Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms