Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms