Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GscQ02591 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GscQ02591 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GscQ02591 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms