Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai1Q02085 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms