Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VcpQ01853 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms