Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms