Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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