Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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