Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SgcdP82347 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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