Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms