Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Otx1P80205 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Otx1P80205 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms