Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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