Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chl1P70232 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms