Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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