Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps18P62270 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms