Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Snap25P60879 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Snap25P60879 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms