Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csrnp3P59055 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms