Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P58686 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P58686 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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