Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpa1P57784 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms