Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CartptP56388 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CartptP56388 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CartptP56388 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CartptP56388 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CartptP56388 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CartptP56388 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms