Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcanP55066 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NcanP55066 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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