Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nub1P54729 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nub1P54729 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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