Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psen1P49769 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms