Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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