Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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