Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ThpoP40226 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms