Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprkP35822 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprkP35822 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprkP35822 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms