Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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