Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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