Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NapbP28663 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NapbP28663 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms