Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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