Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hoxd12P23812 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hoxd12P23812 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hoxd12P23812 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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