Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms