Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NefhP19246 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NefhP19246 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NefhP19246 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NefhP19246 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NefhP19246 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NefhP19246 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms