Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnnc1P19123 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms