Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18526 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18526 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18526 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms