Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtcP11725 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtcP11725 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtcP11725 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtcP11725 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtcP11725 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtcP11725 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtcP11725 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
OtcP11725 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
OtcP11725 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtcP11725 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
OtcP11725 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtcP11725 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
OtcP11725 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms