Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
DmdP11531 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
DmdP11531 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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DmdP11531 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DmdP11531 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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