Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtaP09225 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtaP09225 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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