Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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